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- Variability within a clonal population of Erwinia amylovora disclosed by phenotypic analysisPublication . Mendes, Rafael J.; Silva, M.C.A.; Luz, J.P.; Tavares, Fernando; Santos, ConceiçãoBackground Fire blight is a destructive disease of pome trees, caused by Erwinia amylovora, leading to high losses of chain-of-values fruits. Major outbreaks were registered between 2010 and 2017 in Portugal, and the first molecular epidemiological characterization of those isolates disclosed a clonal population with different levels of virulence and susceptibility to antimicrobial peptides. Methods This work aimed to further disclose the genetic characterization and unveil the phenotypic diversity of this E. amylovora population, resorting to MLSA, growth kinetics, biochemical characterization, and antibiotic susceptibility. Results While MLSA further confirmed the genetic clonality of those isolates, several phenotypic differences were recorded regarding their growth, carbon sources preferences, and chemical susceptibility to several antibiotics, disclosing a heterogeneous population. Principal component analysis regarding the phenotypic traits allows to separate the strains Ea 630 and Ea 680 from the remaining. Discussion Regardless the genetic clonality of these E. amylovora strains isolated from fire blight outbreaks, the phenotypic characterization evidenced a population diversity beyond the genotype clonality inferred by MLSA and CRISPR, suggesting that distinct sources or environmental adaptations of this pathogen may have occurred. Conclusion Attending the characteristic clonality of E. amylovora species, the data gathered here emphasizes the importance of phenotypic assessment of E. amylovora isolates to better understand their epidemiological behavior, namely by improving source tracking, make risk assessment analysis, and determine strain-specific environmental adaptations, that might ultimately lead to prevent new outbreaks.
- Identificação e incidência de doenças de conservação, em cereja da cv. Satin, de acordo com diferentes condições de conservaçãoPublication . Luz, J.P.; Veloso, Abel; Silva, M.C.A.; Simões, M.P.Identificação e incidência de doenças de conservação, em cereja da cv. Satin, de acordo com diferentes condições de conservação, apresenta os resultados da identificação dos agentes patogénicos associados às podridões observadas nas cerejas após conservação.
- PrunusFITO - Avaliação do impacto de alguns inimigos (pragas e doenças) nas culturas das prunóideas na região da Beira Interior e avaliação da eficácia de diferentes meios de luta.Publication . Barateiro, Anabela; Ramos, Cristina; Fragoso, Preciosa; Lopes, Sandra; Abrantes, Ana Celisa; Vieira, Francisco José Pereira; Rebelo, Maria Teresa; Silva, M.C.A.; Luz, J.P.; Coutinho, J.P.; Simões, M.P.O G.O. PrunusFITO surgiu pela necessidade de conhecer melhor as dinâmicas populacionais de alguns dos inimigos mais relevantes em pessegueiro e cerejeira na Beira Interior, estabelecendo-se como prioritários o cancro, a mosca do mediterrâneo, a cigarrinha verde e ratos em pessegueiros, e a mosca de asa manchada em cerejeira. Relativamente ao cancro foram realizadas observações em plantas sintomáticas de 2018 a 2020 e foi recolhido material vegetal do qual foi isolado presuntivamente, Pseudomonas syringae e os isolados bacterianos foram processados através do sistema de identificação Biolog. Todas as bactérias, com identificação presuntiva de Pseudomonas syringae se confirmaram pertencer ao complexo P. syringae. O sistema de identificação Biolog não se mostrou apto para a identificação ao nível infraespecífico e consequentemente será posteriormente realizado um estudo taxonómico com base no perfil bioquímico gerado pelo Biolog. No que respeita à mosca do mediterrâneo, os trabalhos desenvolvidos de 2018 a 2020 consistiram no acompanhamento dos voos da praga em 2 locais da Beira Interior, a sul e a norte da Gardunha, respetivamente. Foram instalados e acompanhados 2 ensaios de captura em massa com utilização das armadilhas com atrativo seco da Bayer (DecisTrap) e armadilhas com atrativo líquido da empresa Bioibérica (CeraTrap), em parcelas distintas. Os resultados indicam níveis populacionais com valores mais elevados na zona a sul da Gardunha. A captura em massa na parcela a norte da Gardunha revelou-se suficiente por si só, enquanto a sul, todos os anos houve necessidade de complementar com luta química. As cigarrinhas verdes foram sinalizadas como emergentes nos pessegueiros na região, onde têm aparecido com frequência e causado estragos em plantas jovens. A monitorização decorreu em 2 pomares na zona a sul da Gardunha. Em 2018 foram colocadas e recolhidas semanalmente 4 armadilhas cromotrópicas amarelas/pomar, de abril a setembro. Em 2019 e 2020 aumentou-se para 6 armadilhas/pomar e alargou-se o período até novembro. Os resultados indicam níveis populacionais elevados de Empoasca solani, na primavera e início do verão, muito elevados de Asymmetrasca decedens no verão e outono e que a poda em verde pode potenciar os ataques, pois em 2018 e 2019, após esta operação, os novos rebentos não se desenvolveram e apresentaram sintomas intensos dos ataques destes insetos. No que diz respeito ao rato-cego (Microtus lusitanicus) foram realizados censos de densidade relativa da espécie, em pomares de pessegueiro, nos períodos de primavera e de outono, com o objetivo de relacionar a densidade relativa com os indicadores de presença e com os estragos causados. Os resultados indicam diferentes densidades relativas e diferentes níveis de estragos em diferentes pomares. Os trabalhos sobre Drosophila suzukii, de 2018 a 2020, consistiram na monitorização da espécie em 3 pomares de cerejeira (Soalheira, Alcongosta e Vale Formoso) e um pomar de mirtilo (Ferro). Complementarmente foi feita a monitorização em mais 2 pomares de medronheiro (Pampilhosa-da-Serra e Castelo Branco). De abril a julho foram colocadas 3 armadilhas/local com diferentes atrativos alimentares – vinagre de cidra, atrativo “composto de vinagre” da empresa Mendes Gonçalves SA e atrativo “Suzukii Trap”, da empresa Bioibérica. Em 2019 e 2020 fez-se a monitorização durante todo o ano, para estudar a flutuação populacional e instalou-se um ensaio de cinco atrativos alimentares, em cerejeira. Os resultados indicam um comportamento diferencial dos atrativos alimentares usados. Estes trabalhos permitem conhecer melhor o comportamento da espécie na cultura da cerejeira na Beira Interior, aspeto essencial para a definição de melhores estratégias de proteção.
- Identificação e incidência de doenças de conservação, em pêssego da cv. Sweet Henry, de acordo com diferentes condições de conservação – atmosfera normal e atmosfera controladaPublication . Luz, J.P.; Veloso, Abel; Silva, M.C.A.; Simões, M.P.Identificação e incidência de doenças de conservação, em pêssego da cv. Sweet Henry, de acordo com diferentes condições de conservação – atmosfera normal e atmosfera controlada apresenta os resultados da identificação dos agentes patogénicos associados às podridões observadas nos pêssegos após conservação.