Browsing by Author "Burban, Christian"
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- Genetic resources in maritime pine (Pinus pinaster Aiton):molecular and quantitative measures of genetic variation and differentiation among maternal lineagesPublication . González Martínez, Santiago; Mariette, Stéphanie; Ribeiro, M.M.A.; Burban, Christian; Raffin, Annie; Chambel, Regina; Ribeiro, Carla Alexandra; Aguiar, Alexandre; Plomion, Christophe; Alía, Ricardo; Gil, Luis; Vendramin, Giovanni Giuseppe; Kremer, AntoinePinus pinaster is a conifer native to western Europe and northern Africa. Following on-going breeding programmes, provenance and progeny trials were established in some of the countries of the species’ range (France, Portugal and Spain) and quantitative traits were measured: growth, stem form, survival and pest and disease resistance, amongst others. Populations from the wide range of P. pinaster were recently screened with molecular markers in order to assess their genetic diversity. Data were obtained using allozymes, chloroplast (cpSSRs) and nuclear (nuSSRs) microsatellites and amplified fragment length polymorphisms (AFLPs). Based on mtDNA-RFLP analysis, three maternal lineages (named ‘‘western’’, ‘‘eastern’’ and ‘‘Moroccan’’) were identified and no population showed a mixed composition. In this study, the imprint that differentiation in putatively isolated glacial refugia (identified by the different maternal lineages) might have left on the nuclear genome was analysed using a wide range of molecular markers and adaptive traits. Multivariate ordination of populations based on nuclear molecular markers (allozymes and nuSSRs) showed a clear clustering of provenances sharing a given mtDNA lineage. However, that clustering was found to be less tight when only quantitative traits were investigated. In P. pinaster, the within-population estimates of gene diversity using different traits were not correlated. Therefore, caution is advisable when designing conservation strategies based on molecular marker studies or a limited number of populations. After these results, we recommend a conservation strategy characterised by gene flow consistent with the current population structure, careful seed transfer among maternal lineages (if any), selection of populations for conservation based on the originality of their allelic composition and definition of Management Units (MUs) based on adaptive traits..
- O impacto do homem na estrutura de uma espécie: Portugal, um paradigmaPublication . Ribeiro, M.M.A.; González-Martínez, Santiago; Burban, Christian; Plomion, Christophe; Vendramin, Giovanni GiuseppeA bacia do Mediterrâneo é caracterizada pelo tradicional desaparecimento da floresta devido à acção do Homem e o impacto humano tem tido influência na alteração da diversidade genética. O pinheiro bravo ocorre em populações fragmentadas na região oeste da bacia do Mediterrâneo e a sua área de distribuição tem sido alterada nos últimos séculos devido a intensa florestação, em particular no SW de França e no Noroeste da Península Ibérica e, também, devido ao comportamento invasivo desta espécie em áreas perturbadas do ponto de vista ecológico. Nesta apresentação pretendemos sintetizar e discutir o resultado de estudos que utilizaram técnicas moleculares para revelar a diversidade do pinheiro bravo e, também, o impacto humano na sua estrutura genética; que é demonstrado paradigmaticamente em Portugal. Os parâmetros genéticos estimados com base em microsatélites do cloroplasto (cpSSR) revelaram que a diversidade genética é muito elevada ao nível da distribuição da espécie. Observou-se uma clara e significativa diferenciação entre grupos de populações de diferente origem geográfica (Portugal, França, Itália, Espanha e Marrocos). Pelo contrário, o grau de divergência dentro dos países é geralmente muito baixo ou próximo de zero, o que indica uma variação homogénea dentro dos grupos. A presença de diferenciação entre grupos de populações de diferentes áreas reflecte a existência de diferentes refúgios durante o Quaternário. Em França, o padrão haplotípico sugere uma mistura de material proveniente de diferentes origens. Só foram encontrados 3 mitótipos, usando marcadores mitocondriais, marcador de herança maternal, o que proporciona uma imagem clara de áreas colonizadas a partir dos diferentes refúgios; nem uma só população possui uma composição mista. Uma análise filogenética feita com base em isoenzimas mostrou que a estrutura geográfica do pinheiro bravo na Península Ibérica (PI) é muito elevada. As populações de Noroeste formam um grupo e as de Sudeste outro. Observou-se níveis elevados de diversidade nas populações de Este e Sul e uma redução importante da variabilidade em populações da região Noroeste da PI. No entanto, pode ter existido em Portugal um refúgio, pois o pinheiro bravo pode ter sobrevivido durante a última glaciação em zonas abrigadas e de baixa altitude junto ao Oceano Atlântico, o que parece também ser evidente devido a descobertas de pólen e carvão fóssil. A distribuição da variação genética do pinheiro bravo em Portugal, observada através de cpSSR indica que a diferenciação entre populações é baixa e que a diversidade existe principalmente dentro das populações. Não se observa nenhum padrão geográfico, mas as evidências existentes de uma forte influência antrópica antropogénica associada a um fluxo genético extensivo poderiam explicar esse resultado.