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Identificação de cultivares por microssatélites - aplicação à ervilha proteaginosa
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Abstract(s)
O objectivo deste trabalho foi realizar a identificação, por marcadores moleculares do tipo microssatélites, de 20 cultivares de ervilha proteaginosa, inscritas no catálogo comunitário de variedades. A extracção de DNA foi realizada com o DNAeasy Plant Mini Kit. Foram estudados 7 marcadores moleculares SSRs com o objectivo de detectar polimorfismos. Os fragmentos resultantes de amplificação foram separados por electroforese em gel de agarose MS-8, a 3,5% (w/v), em tampão TBE 1x, com coloração com brometo de etídio. Foi usado o marcador 100pb ladder da Biotools. Para cada locus foi calculado o valor PIC (Polymorphic Index Content) e os dados foram processados com utilização do software estatístico NTSYS-pc, vs. 2.21k. Foi utilizado o módulo SIMQUAL com coeficiente de similaridade de Jaccard, seguido de análise de cluster UPGMA (unweighted pair-group method with arithmetic mean). No total dos 7 loci foram registados 20 alelos. Foram detectados polimorfismos em 6 dos loci estudados, tendo sido construída uma tabela de código binário com os resultados obtidos. O valor PIC variou entre 0,42 (A9) e 0,58 (AB53). Registou-se a existência de reduzido número de heterozigóticos o que é consentâneo com o facto de ser uma espécie autogâmica. Com base em 6 marcadores SSRs é possível distinguir praticamente todas as cultivares. Apenas as cultivares Ideal e Alezan apresentam perfis idênticos para os 6 loci utilizados na análise identificativa. O dendrograma representante das relações genéticas existentes entre cultivares, construído por análise de cluster UPGMA, com base nos coeficientes de similaridade de Jaccard, permite constatar a existência de dois grandes grupos. No primeiro grupo incluem-se as cultivares Cleopatra, Alhambra, Ideal, Alezan, Pixel, Lumina, Cherokee, Gregor, Livia, Guifilo, Guifredo, Onix, Arthur, Enduro e Grisel. Esta última, de origem portuguesa, aparece geneticamente distanciada das restantes. No segundo grupo incluem-se as cultivares Isard, Cartouche, Audi, Corrent e James.
Description
Comunicação apresentada no Seminário "Cereais e Leguminosas: Novas Perspectivas para a Beira Interior", que se realizou em 29 de Junho, em Castelo Branco, na Escola Superior Agrária do Instituto Politécnico de Castelo Branco.
Keywords
Ervilha Pisum sativum Microssatélites SSRS
Pedagogical Context
Citation
REIS, C.M.G. ; DIOGO, M.G. (2009) - Identificação de cultivares por microssatélites - aplicação à ervilha proteaginosa. In Seminário "Cereais e Leguminosas: Novas Perspectivas para a Beira Interior", Castelo Branco, 29 Junho. Comunicação oral.